生态旅游经济的发展固然重要，与此同时，在开发的过程中也要注意保护景物的原始形态。即使我国的旅游资源十分丰富，旅游景区的开发也要遵循相应的原则以保护原始的自然环境。不仅如此，景区的开发方案也要因地制宜，不同的地理条件以及地势特点是景区开发需要考虑的必要因素，将当地的独特之处与相关的旅游项目相结合会为旅游经济带来相当大的推动力。除此之外，对于生态旅游的景区开发也要与大多数游客的需求相匹配，因为游客是带动旅游行业经济发展的关键因素，所以，旅游公司也要在最大程度上满足游客对于景区景点的心理需求，这样才能够带动旅游生态经济进一步发展。

同时，合理开发生态旅游也必须要按照一定的科学方法和规律，不能为了开发生态旅游而破坏生态环境，应当遵循以下原则：
1、保护自然生态环境原则
旅游业的开发建设离不开自然生态资源，要想不断更新发展旅游产品，必定会涉及自然生态旅游资源。在旅游开发建设上，一方面要对环境进行保护，另一方面要需要对资源环境进行开采整合，这本身就是相互矛盾的。但是，我们在开发旅游资源上应当做出合理规划，对自然资源及人文资源做出相应的保护，有的资源是可再生的，比如植被，有的资源却是不可再生的，比如岩石洞穴、世界物质文化遗产，一旦遭到破坏就不能恢复原貌。所以，在进行旅游产品开发、资源开采时，一定要以保护自然生态环境为首要原则。
2、可持续发展利用原则
在建设生态旅游景区时，应当考虑到是否可持续发展利用资源。保护生态环境是前提，可持续发展利用是目的。旅游公司应当有义务做好环境保护方面的宣传，通过设计旅游产品，让人们参与到保护大自然环境当中，在游客享受到大自然赋予的能量时，有意识地去保护资源。